NAS一旦做好准备，商用和军用无人机系统就会进入，这也是联邦航空局下一代空中交通管制现代化项目的目标，目前正处于实施阶段，其中涉及到对无人机进入国家空域进行验证，确保新的管理条令能够满足无人机系统数量不断增长的需求等。目前所面临的挑战既包括条令制订方面也包括技术方面，FAA目前已经决定投资建设6个试验基地，具体筹建工作今年稍后启动。
“丢失链”问题，即无人机系统在与地面失去联系的情况下如何行动也是一大难题，这是因为对于交通管制来说如何在飞机没有飞行员的情况下确保所有的飞行条令都被严格遵守是更为棘手的问题。另外，没有受保护的用于安全通信的频谱也是一大难题。
