位于荷兰的非营利组织“影子视野基金会”是运行此类无人机的机构之一，其飞行器已在非洲投入广泛使用。通过改装可从商业渠道取得的技术设备，该基金会开 发了“影子旋翼”，这是一款经过改良的“四轴飞行器”(有4个旋翼)，能够飞行1个小时，大约是消费者型号飞行时间的3倍。
这种飞行器能贴着森林树冠低空飞行，采集安装在动物身上的标牌发出的信号；这些动物可能游荡到距离护林员驻地太远的地方，难以使用地面监测手段。
影子视野基金会更大的固定翼无人机被用于南非克鲁格国家公园的反偷猎巡逻。这种无人机被命名为“生态护林员”，它更接近军用无人机，而非业余爱好者的机 型。它需要一条跑道(或者至少是一段简易跑道)进行起飞和降落。但基金会的联合创始人史蒂夫·鲁斯特表示，正是把无人飞行器制作得更小、造价更低廉的消费 者科技，使无人机在更广泛的动物保护计划中得到应用。
同时，在更南端的地方，世界自然基金会(WWF)出资支持由英国南极调查局(BAS)在南奥克尼进行、以及法国研究者在南极进行的企鹅种群调查。法国研究者正在追踪阿德利企鹅，就像英国百货商店John Lewis广受欢迎的圣诞节广告中的企鹅蒙蒂。
企鹅身上安装了数据记录器和全球定位系统标牌，能追踪它们的入水和出水动作。一些企鹅身上还安装了能与Argos特种卫星连接的装置。BAS团队不久将在亚松半岛上追踪帝企鹅。世界自然基金会极地项目经理罗德·唐尼将BAS团队工作的南大洋描述为“世界上剩下的原始面貌保持得最好的大洋之一”，他表示，“我们在南大洋的目标是设计一个海洋保护区网络”。
英国自然保护慈善基金——皇家鸟类保护协会(RSPB)也在将越来越多的廉价追踪设备、微型摄像头和无人机应用于鸟类和自然栖息地的保护工作。
RSPB正利用卫星来追踪黑兀鹫。这一物种的数量在1992年至2007年期间减少了90%。
据信，南亚用于治疗牲畜的一种药物容易导致这种鸟类死亡。然而，RSPB正试图找出黑兀鹫的实际死亡原因。当一只装有追踪设备的黑兀鹫死亡时，RSPB会利用追踪设备提供的信息将尸体找回，然后实施尸检，以确定死亡原因。
RSPB还在一些体型小得多的鸟类身上安装了追踪设施，比如红颈瓣蹼鹬。人们以往认为，这种在苏格兰北方群岛繁衍的鸟类最南会迁徙到印度洋。然而，利用 一种被称为“地理位置光传感器”的追踪装置(仅重0.7克)，RSPB发现，英国的红颈瓣蹼鹬最南会迁徙到加拉帕哥斯群岛。
