与所有无人技术一样，AUV的自主性是一个热门课题。目前，大多数民用和商业AUV系统需要预编程，Bluefin机器人公司制造的一系列AUV系统也是如此。公司为包括麻省理工学院（MIT）在内的各种研究团体及一些商业测量公司提供AUV。上世纪90年代后期，Bluefin机器人公司从MIT AUV实验室脱离出来，并开始为美国国内的科研和防务市场生产了一些AUV系统，其最初的产品已发展成Bluefin-21。
如今，Bluefin机器人公司的所有AUV系统包含：1个装主电子装置的小型耐压容器；1个完全由万身支架支撑的推进器；通信器件，包括天线、应急骂人和一些核心传感器；装耐压电池组的能源部分使操作者可在甲板上迅速更换电池组，以便有更多时间在水下收集数据；任务载荷部分。
任务载荷部分包括：一些有确定系统应用和任务的部件，典型部件包括测扫描声纳、合成孔径声纳、多波束回声探测声纳、摄像机，以及在海上超回收器件作用的头锥，还榀以安装防撞用的前视声纳。
Bluefin机器人公司正在不断增加其AUV的自主能力，但目前其所有AUV都需要预编程。操作员可通过该公司的计划软件设计任务，然后将任务加载到AUV上并进行功能测试后潜入水中，开始执行任务指令。
在执行任务期间，AUV将自身工作状态以声音信号方式传送到甲板上的计算机，以供操作员跟踪系统及监控其健康状态所用。一量完成了任务，AUV便被回收到甲板上，更换电池组，取下数据装置并下载数据，然后准备进行再次部署。
不同的任务和测量需要不同的操作概念。例如，对沉船的广域搜索需要AUV在特定水下尝试搜索海底大面积的平直部分，如果发现沉船，AUV就会下潜到要求的深度，摄取更小、更具体的失事区域的照片。
若要采集北极不同区域的实际水样，AUV的任务就要设计成能进出采集水样的冰场，或者潜到深处，关掉推进器，并在上浮到水面的过程中在各个高度采样。
