据美国防务新闻网2019年6月12日刊文，美国防务新闻网近日指出，目前F-35项目仍然备受瑕疵和故障困扰，如果这些问题不解决，将会使飞行员面临安全风险，并且战斗机完成关键任务的能力也会受到质疑。而美国国防部F-35项目办公室回应称“没有任何问题对飞行员，飞行任务或F-35机身造成任何严重或灾难性风险”。洛·马公司也表示目前已部署的F-35战机已达到或超过性能规格。
美国防务新闻网独家获取的文件详细描述了F-35项目存在的13个最严重的缺陷，包括与每个问题相关的情况，如何影响F-35的行动以及美国国防部改善它的计划。但是这些问题大多数尚未公开披露，这表明美国国防部最昂贵和备受瞩目的武器系统缺乏透明度。针对存在的问题，F-35项目办公室仍在努力应对严重的技术问题。文件中描述的13个严重的缺陷包括：
- F-35的物流系统目前无法供国外F-35运营商使用，这样可以避免他们的秘密数据被传送到美国。
- F-35物流系统不能够总是如实反映备件库存，偶尔会导致任务取消 。
- 已知F-35座舱内的机舱压力峰值会引起气压伤，即引起难以忍受的耳朵和鼻窦疼痛。
- 在零下30华氏度或接近零下30华氏度的条件下， F-35会错误地报告其中一个电池发生故障，有时会导致任务中止。
- 超过1.2马赫的超声速飞行会对F-35B和F-35C的隐身涂层造成结构损坏和起泡。
- 在进行某些操作后，F-35B和F-35C飞行员并不总能完全控制飞机的俯仰，俯仰和偏航。
- F-35A和F-35B在着陆时，轮胎与地面撞击可能导致两条液压管路弹出并造成飞机损失风险。
- 头盔式显示器上有时会出现“绿色发光”，使F-35C难以降落在航空母舰上。
- 在星光很少的夜晚，夜视摄像机有时会显示绿色条纹，影响飞行员视野。
- F-35雷达的海上搜索模式只能照射海面的一小部分。
- 当F-35B在非常炎热的天气中垂直着陆时，较旧的发动机可能无法产生所需的推力以保持喷气机空降，从而导致硬着陆。
2019年底，美国国防部领导人将就是否“停止F-35研发阶段并全速生产”做出关键决定 。 在此期间，F-35的年产量将从2018年的91架猛增至2023年的160架。
一般而言，美国国防部的政策要求在全速生产开始之前要消除所有缺陷，这是为了避免现在的飞机再花费大量费用进行改造。
美国国防部F-35项目执行副主任Mat Winter表示，F-35联合项目办公室正在取得快速进展，但并非所有问题都将在全速生产决策之前得到解决。在美国国防部确定是否开始全速生产之前，上述13个问题中有9个可能会被纠正或降级为2类状态，另外2个将在未来的软件版本中进行裁决。但是，F-35项目办公室无意纠正文件中提到的两个问题，而美国国防部选择接受额外的风险。
Winter坚持认为，没有任何问题对飞行员，飞行任务或F-35机身造成任何严重或灾难性风险。 在与国防新闻联系后，项目办公室创建了两个类别的1类问题的名称，以突出可以作为紧急情况的问题与其他更为轻微的问题之间的差异。
Winter指出， 1-A类是指造成生命损失，潜在的生命损失，装备飞机的损失的问题。这些类别的问题必须在几小时，几天内解决。F-35目前没有类别 1-A缺陷。而这些文件中提到的缺陷都属于1-B类，这类问题是“具有任务影响的问题”，战斗机可以接受当前的解决方案，并且知道F-35项目办公室将来能够纠正这种不足。
洛·马公司负责F-35项目的副总裁Greg Ulmer表示，目前已部署的F-35战机已达到或超过性能规格。
