在“9·11”事件以后，美国无人机项目一直由中情局掌管。奥巴马政府正在考虑，让军队负责所有无人机袭击事务是否会减轻目前由中情局掌管而带来的法律问题，是否会增加国会与民众对项目的担忧。
在国会山，很多议员说他们主要担心的是，这个已成美国对抗“基地”组织最大秘密工具的项目会落到军方手中。
他认为，那些担心中情局在美国本土地美国公民发动无人机袭击是否会违宪的担心是不必要的，保持中情局对无人机项目的控制是很明智的。“我不担心我们放弃自己宪法权利去追剿恐怖分子——我认为我们可以接受目前状态。”他说。
也有很多议员担心军方并不是很精通或不适合执行无人机任务，而中情局在这方面已经做得很完美了。
而支持将军用无人机项目移交给军方的人则认为，这能增强对“基地”组织领导与成员使用无人机的合法性。一位前五角大楼的首席律师约翰逊3月18日在纽约的福特汉姆大学法学院的演讲中说：“美国军方的主要任务是抓捕或杀死敌人，作为由国会批准的武装行动的一部分，无人机项目的基础会更加牢靠。同时，国会批准武装行动的标准对公众是透明的，必须由国会授权，行政部门解释授权。在国会批准武装行动标准之外的那些致命武器，在公众看起来是缺少限制的，也使人怀疑它是否只是代替刑事司法的权宜之计。”
报道称，可以肯定的是，在反对“基地”组织领导人和成员的任务到底归军方还是情报机构的问题上，双方各执一词，僵持不下。有的认为“大部分的责任应由军队”，而有人认为中情局在实施武装袭击前有一个严谨的决策过程,但“军队的武装无人机项目却没那么讲究。”
战略与国际研究中心分析师，情报顾问安东尼说,军方和中情局使用无人机袭击的方法是相当不同的。“跟大多数军事行动相比，情报机构在不同信息和方法,和不同时间压力的基础上进行活动，所以我认为这两都可能都需要。”
